Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPS8Q99627 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS8Q99627 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms