Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ANKRD27Q96NW4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms