Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SCLT1Q96NL6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms