Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SAMD8Q96LT4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SAMD8Q96LT4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms