Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SENP8Q96LD8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SENP8Q96LD8 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms