Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LIN37Q96GY3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms