Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RRP36Q96EU6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RRP36Q96EU6 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms