Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SIRT1Q96EB6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SIRT1Q96EB6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms