Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GTF3C6Q969F1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GTF3C6Q969F1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms