Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM7

STAG1, Cohesin subunit SA-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG1Q8WVM7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
STAG1Q8WVM7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
STAG1Q8WVM7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms