Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCAF4Q8WV16 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms