Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE04

PANK1, Pantothenate kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PANK1Q8TE04 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PANK1Q8TE04 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PANK1Q8TE04 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms