Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATL2Q8NHH9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATL2Q8NHH9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms