Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HELBQ8NG08 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HELBQ8NG08 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms