Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC148Q8NFR7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC148Q8NFR7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms