Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PIK3C3Q8NEB9 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PIK3C3Q8NEB9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms