Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCQ3

LINC00301, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00301, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00301Q8NCQ3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LINC00301Q8NCQ3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LINC00301Q8NCQ3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms