Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP38Q8NB14 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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