Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC63Q8NA47 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC63Q8NA47 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms