Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf62Q8N4C0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf62Q8N4C0 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms