Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U4

STAG2, Cohesin subunit SA-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG2Q8N3U4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG2Q8N3U4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG2Q8N3U4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms