Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLD3Q8IV08 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLD3Q8IV08 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms