Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KNDC1Q76NI1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KNDC1Q76NI1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KNDC1Q76NI1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KNDC1Q76NI1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KNDC1Q76NI1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms