Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW61

BBS12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS12Q6ZW61 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
BBS12Q6ZW61 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms