Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFAP47Q6ZTR5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms