Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSY5

PPP1R3F, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3FQ6ZSY5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPP1R3FQ6ZSY5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPP1R3FQ6ZSY5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPP1R3FQ6ZSY5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3FQ6ZSY5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3FQ6ZSY5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3FQ6ZSY5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3FQ6ZSY5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3FQ6ZSY5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3FQ6ZSY5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3FQ6ZSY5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3FQ6ZSY5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3FQ6ZSY5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3FQ6ZSY5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3FQ6ZSY5 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3FQ6ZSY5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3FQ6ZSY5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3FQ6ZSY5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3FQ6ZSY5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3FQ6ZSY5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3FQ6ZSY5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3FQ6ZSY5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPP1R3FQ6ZSY5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms