Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LINC00299Q6ZSB3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00299Q6ZSB3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms