Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC129Q6ZRS4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC129Q6ZRS4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms