Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMN7

PDZRN4, PDZ domain-containing RING finger protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN4Q6ZMN7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDZRN4Q6ZMN7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms