Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ATRAIDQ6UW56 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms