Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC41PQ6P2S7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms