Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUI1

CCDC144NL, Putative coiled-coil domain-containing protein 144 N-terminal-like, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144NLQ6NUI1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CCDC144NLQ6NUI1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms