Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ANKRD40Q6AI12 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms