Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CREB3L3Q68CJ9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CREB3L3Q68CJ9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms