Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ALS2CLQ60I27 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms