Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF123Q5XPI4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF123Q5XPI4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms