Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRCH2Q5VUJ6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms