Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT52

RPRD2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD2Q5VT52 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RPRD2Q5VT52 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RPRD2Q5VT52 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms