Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
STRIP1Q5VSL9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
STRIP1Q5VSL9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms