Protein–RNA interactions for Protein: Q5T8R8

C9orf66, Uncharacterized protein C9orf66, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf66Q5T8R8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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C9orf66Q5T8R8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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C9orf66Q5T8R8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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C9orf66Q5T8R8 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
C9orf66Q5T8R8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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