Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC4Q5GLZ8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC4Q5GLZ8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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