Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAVIN4Q5BKX8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms