Protein–RNA interactions for Protein: Q569G3

C5orf47, Uncharacterized protein C5orf47, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf47Q569G3 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C5orf47Q569G3 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C5orf47Q569G3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C5orf47Q569G3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C5orf47Q569G3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C5orf47Q569G3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C5orf47Q569G3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C5orf47Q569G3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C5orf47Q569G3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C5orf47Q569G3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C5orf47Q569G3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
C5orf47Q569G3 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C5orf47Q569G3 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C5orf47Q569G3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C5orf47Q569G3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
C5orf47Q569G3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
C5orf47Q569G3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms