Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL12Q53G59 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms