Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC39A12Q504Y0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC39A12Q504Y0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms