Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NBPF8Q3BBV2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NBPF8Q3BBV2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms