Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL38Q2WGJ6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL38Q2WGJ6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL38Q2WGJ6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL38Q2WGJ6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL38Q2WGJ6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KLHL38Q2WGJ6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL38Q2WGJ6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL38Q2WGJ6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL38Q2WGJ6 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL38Q2WGJ6 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL38Q2WGJ6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
KLHL38Q2WGJ6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KLHL38Q2WGJ6 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms