Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VWC2Q2TAL6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms