Protein–RNA interactions for Protein: Q2T9J0

TYSND1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYSND1Q2T9J0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TYSND1Q2T9J0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms