Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ISXQ2M1V0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ISXQ2M1V0 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms